RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因

为揭示DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）在肝癌中是否参与了肿瘤的发生,应用Western blotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达。构建了DNMT3B的RNAi稳定表达的重组载体,并转染人肝癌细胞株SMMC-7721中。以半定量RT-PCR及Western blotting分别鉴定DNM73B RNAi表达载体对内源性DNMT3B的抑制效率。用高通量的cDNA基因芯片分析了SMMC-7721中DNMT3B抑制后有影响的下游基因谱。结果显示,DNMT3B在肝癌细胞株中的表达水平明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞株。DNMT3B的RNAi稳定表达重组载体转染SMMC-7721细胞株2个月后,观察到DNMT3B明显受到抑制。cDNA基因芯片分析发现,DNMT3B抑制后诱导26条基因表达下调,115条基因表达上调,包括一些发育相关基因以及肿瘤相关基因,如SNCG、NOTCH1、MBD3、WNT11、MAOA、FACL4等。提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生有关,并以调控其他相关基因的表达而起作用,包括与发育相关的重要基因。     

Resource limitation and pollen source (self and outcross) affecting seed production in two louseworts, Pedicularis siphonantha and P. longiflora (Orobanchaceae)

Two animal-pollinated hermaphrodite plants, Pedicularis siphonantha and P. longiflora , have been used to investigate factors limiting seed production in natural populations. To evaluate the potential seed abortion due to resources limitation, seed development has been observed and seed count conducted twice. Seed production per capsule has been compared when flowers have been removed and in a control group. Open pollination has been investigated and pollen supplementation undertaken to estimate the possibility of pollen limitation. Results show that seed abortion is frequent. Stigmatic pollen load is significantly higher than ovule number per ovary under open pollination for both species. Additional self and outcross pollen did not affect seed production. Flower removal significantly increases seed production per capsule, which indicates that seed production of the studied species is limited by available resources. To detect differences in seed production between flowers pollinated by self and outcross pollen, hand pollination of bagged flowers has also been conducted in natural populations of the two Pedicularis species. Compared with open pollination, hand-pollinating self-pollen decreases, while outcross pollen increases seed production per capsule. Such results suggest that inbreeding depression in the two self-compatible species may also result in partial seed abortion under open pollination if mixed pollen is deposited on the stigma. Our results also suggest that pollen interference plays an important role in low female fertility in the two Pedicularis species.  © 2005 The Linnean Society of London, Botanical Journal of the Linnean Society , 2005, 147 , 83–89.     

RNA干扰抑制SiHaB2细胞中Bcl-2基因的表达

Bcl-2基因作为细胞凋亡的一个潜在抑制剂调节细胞的死亡,抑制恶性肿瘤细胞中Bcl-2基因的表达可促进肿瘤细胞的凋亡。采用RNA干扰技术,合成了含有21个核苷酸的小双链干扰RNA（siRNA．Bcl-2）,并构建了含有19个核苷酸基因的质粒载体（pSilencer2．1-U6-Bcl-2）,把合成的siRNA．Bcl-2和pSilencer2．1-U．Bcl-2分别转导入Bcl-2高表达的细胞株SiHaB2中,通过Western印迹检测,免疫荧光法检测及DNA梯（ladder）检测,可观察到在导入siRNA．Bcl-2和pSilencer2．1-U．Bcl-2的SiHaB2细胞被培养72h后,可以明显抑制Bcl-2蛋白的表达。     

马缨丹乙醇提取物对美洲斑潜蝇种群的控制作用

应用作用因子生命表方法以及在此基础上提出的干扰作用控制指数法评价了马缨丹(LantanacamaraL.)乙醇提取物(干重1g·100mL-1)在美洲斑潜蝇LiriomyzasativaeBlanchard种群控制中的作用。结果表明,马缨丹乙醇提取物对保护菜豆(PhaseolusvagarisL.)免受美洲斑潜蝇为害起着明显的作用。处理区的干扰作用控制指数为0.135,即对美洲斑潜蝇的防治效果可达86.5%。马缨丹乙醇提取物对美洲斑潜蝇寄生性天敌的作用无影响。     

siRNA, miRNA and HIV: promises and challenges

INTRODUCTION The recent discovery of small interfering RNA (siRNA) revealed an important role for small RNAs in regulating gene expression. First described in plants, as “post- trancriptional gene silencing” (PTGS) [1], RNA interfer- ence (RNAi) is a nucleic-acid based immune defense against viruses, transgenes and transposons [2]. Triggered by double-stranded RNA (dsRNA), RNAi leads to the se- quence specific degradation of a target mRNA [3]. In eukaryotic cells, long dsRN…     

RNA干扰文库及其在功能基因组学研究中的应用

随着人类基因组大规模测序的完成,下一步的挑战是了解每一个基因的功能 . RNA 干扰文库为大规模基因功能筛选提供了可能 . 虽然用于线虫等模式生物的 RNAi 文库,已经证明是大规模基因功能筛选的有效方法,但这些文库不能用于高等动物的细胞 . 自 2003 年以来,用于人的细胞和哺乳动物细胞的 RNAi 文库取得了突破,相继出现构建已知基因 RNAi 文库和构建随机 RNAi 文库的报道,并成功地应用于大规模基因功能的筛选 . RNAi 文库作为一种简单、高效、大规模、高通量的功能基因组学研究的工具,将在基因功能研究、发现新的药物靶基因、发现疾病相关基因等方面有广阔的应用前景 .     

siRNA对SARS冠状病毒复制的抑制作用

为探讨siRNA在哺乳动物细胞中对SARS冠状病毒复制的抑制作用,针对BJ0 1株SARS冠状病毒复制酶基因(Pol)和刺突蛋白基因(S) ,设计4个siRNA ,并构建相应的siRNA表达载体及克隆细胞系.利用间接免疫荧光法及实时定量反转录PCR法,检测所设计的siRNA对SARS冠状病毒复制的抑制作用.结果表明,针对Pol基因的siRNA(psOe)在Vero细胞中可阻断BJ0 1株SARS病毒RNA的复制及其蛋白的表达.该结果为深入阐明SARS冠状病毒的致病机理及探讨SARS病毒防治新途径奠定了基础.     

RNA干扰技术抑制Polo-like激酶1表达对A549细胞的影响

Polo-like激酶1(Plk1)是参与细胞周期调控的重要分子,已在多种肿瘤中检测到Plk1的高表达,并发现与肿瘤细胞的增殖和预后密切关联.为明确Plk1在肺癌细胞系A549细胞增殖和周期运行中的作用,采用RNA干扰技术,构建能产生siRNA的质粒载体psiRNA-hH1-Plk1并导入A549细胞中.采用RT-PCR检测Plk1mRNA表达的变化,Western印迹检测Plk1、细胞周期蛋白B1、p53蛋白的表达变化,流式细胞术分析细胞周期变化和凋亡;免疫荧光染色检测α微管蛋白的表达.以此观察RNA干扰能否有效抑制Plk1的表达水平,以及抑制后对A549细胞生长的影响.结果表明,psiRNA-hH1-Plk1质粒能特异性地抑制Plk1基因的表达并使其活性下降,细胞周期蛋白B1及p53蛋白的表达水平升高,微管聚集障碍或形成单极的纺锤体,A549细胞增殖减慢,出现G2/M期阻滞并存在细胞凋亡.针对Plk1基因的RNA干扰有望用于肿瘤的基因治疗.